En el año 1961 la carencia de especialistas en Fisiología conlleva a que los Profesores de la Universidad de Antioquia vengan a dictar la cátedra.En 1976, la creación del Departamento de Ciencias Químicas desmantela el Departamento de Ciencias Fisiológicas ya que se lleva parte locativa, equipos de laboratorio, depósito y Docentes.

En 1986, por Resolución Rectoral el Ingeniero HAROL MUÑOZ MUÑOZ, a todos los Docentes del Departamento no Médicos los pasa a la Facultad de Educación. En el campo investigativo se desarrollaron proyectos como: «síntesis de complejos de platino con posibilidad anticancerigena. evaluación farmacológica y fisiológica a nivel renal» y «evaluación farmacológica de plantas medicinales con probable actividad antiinflamatoria» y otros.

El Departamento contó con docentes preparados en las diferentes áreas que manejaba en ese momento como: Biología, Bioquímica, Fisiología, Biofísica y Farmacología; impartiéndolas en los programas de: Medicina y Enfermería. Con la creación de los programas de Fisioterapia y Fonoaudiología; a partir de 1998 los docentes del Departamento entran a prestar sus servicios en todas las Asignaturas de Ciencias Básicas.

Mediante el convenio Universidad del Valle Universidad del Cauca se crea el programa de Educación Física donde los docentes del Departamento también imparten las asignaturas básicas.