El Doctorado busca fundamentalmente, la formación de investigadores capaces de liderar, promover y formar parte de procesos académicos y científicos, con habilidades para la síntesis y evaluación autónoma de ideas nuevas y complejas con espíritu crítico, con el conocimiento de las metodologías teóricas, experimentales y tecnológicas, que la química ofrece en distintos campos, por medio del cual puedan abordar los retos que impone la química básica y aplicada, proponer proyectos de investigación que impacten positivamente, en especial en la región caucana y pacífica y comunicar adecuadamente los contenidos científicos resultantes de sus tareas investigativas.