El Departamento de Medicina Interna está conformado por un equipo multidisciplinario de profesores, responsables de la formación del médico general en el pregrado y del especialista de medicina interna en el posgrado.

Al Departamento pertenecen un selecto grupo de médicos especialistas en medicina interna varios de los cuales tienen formación supra-especializada en los campos de Cardiología, Nefrología, Endocrinología, Gastroenterología, Neumología, Neurología, Reumatología, Medicina del Cuidado Critico, Hemodinámica y Hematología; además, pertenecen al equipo de profesores especialistas de las áreas de: Radiología, Oncología, Medicina Física y Rehabilitación, que aportan su saber a la docencia, la investigación y la interacción social en la formación del pregrado y posgrado. Los cuales desarrollan su labor formativa en las unidades de urgencias, hospitalización medica, medico quirúrgica, cuidado intermedio y cuidado intensivo, así como en las unidades de cardiología, nefrología, gastroenterología y rehabilitación de los Hospitales Universitarios San José y Susana López, así como en la Clínica la Estancia en la ciudad del Popayán.

Además pertenecen al Departamento, un amplio equipo de profesionales especialistas en las áreas de Microbiología, Parasitología, Laboratorio Clínico que orientan la formación básica y clínica en la enfermedad infecciosa y constituyen la Unidad de Ciencias Biomédicas, desarrollando parte de su labor en el Laboratorio Unificado de la Facultad de Ciencias de la Salud. También pertenece al Departamento una abogada bioeticista que orienta la formación en el área de Bioética. También hacen parte del equipo docente tres médicos psiquiatras que orientan la formación del médico general y del especialista del Departamento en el manejo de los problemas de salud mental, contando con el espacio de la Unidad de Salud Mental del Hospital Universitario San José, para las prácticas clínicas.