En 1996 el Consejo Superior de la Universidad del Cauca crea la Facultad de Ciencias Humanas y Sociales, y un año después, en 1997, los Departamentos de Geografía y de Historia, instaurando una etapa moderna y renovada de los programas. El Departamento de Geografía, está conformado por un único programa: Geografía del Desarrollo Regional y Ambiental.

El Programa de Geografía del Desarrollo Regional y Ambiental, hace énfasis especial en los contenidos que permitan a sus egresados participar en la formulación de propuestas que lleven al desarrollo de las diversas regiones y del entorno ambiental. Los énfasis del programa responden en buena medida a los requerimientos del espacio en el cual la Universidad está inserta. En este sentido, el programa ha trabajado en investigaciones que tienen que ver principalmente con los estudios de ordenamiento territorial, planes de desarrollo municipal, estudios de riesgos ambientales y de aspectos específicos en el ámbito regional orientados al análisis de dinámicas en materia de desarrollo, de oportunidades sociales, de pobreza, de sistemas de información geográficas aplicados al estudio de cuencas hidrográficas, de cobertura y uso del suelo y a aspectos socio económicos, que lo diferencian de los otros programas que se ofrecen en el país.